讀特客戶(hù)端·深圳新聞網(wǎng)2022年1月12日訊(深圳商報記者 袁靜嫻)近幾日,深圳市疾控中心的應急實(shí)驗樓徹夜燈火通明。這里是深圳市疾控中心新冠溯源團隊的實(shí)驗場(chǎng)所。從1月6日晚上,拿到此次“0107”疫情的第一個(gè)新冠病毒核酸檢測陽(yáng)性樣本開(kāi)始,這支團隊已經(jīng)連軸轉了4天5夜。
1月10日,深圳通報,“0107”疫情前4個(gè)病例感染的毒株均為德?tīng)査儺愔辏ˋY.103進(jìn)化分支),且100%同源。綜合分析,本起疫情源頭為境外輸入引起的本土疫情,暴露于境外新冠病毒污染物品引起感染的可能性大。為查清疫情源頭做出重大貢獻的,正是深圳市疾控中心新冠溯源團隊。
“早一分鐘確定傳染源,就為跑贏(yíng)新冠病毒增加多一分勝算?!?0日,深圳市疾病預防控制中心病原生物研究所副所長(cháng)、深圳疾控新冠溯源團隊負責人何雅青接受讀創(chuàng )/深圳商報記者專(zhuān)訪(fǎng)時(shí)如此表示。此次,何雅青帶領(lǐng)的團隊僅用16小時(shí),就查清了本起疫情病例1、2感染的新冠病毒型別,較之前足足提前了8小時(shí)。
爭分奪秒,凌晨5點(diǎn)狂奔回所
時(shí)間回到1月6日。
當天晚上10點(diǎn)半左右,何雅青接到深圳本地的“10混1”核酸檢測樣本里有一個(gè)呈可疑陽(yáng)性,拿到核酸初篩的熒光PCR結果圖,看了幾眼,憑著(zhù)豐富的經(jīng)驗,她已基本確定深圳可能出現新冠病毒感染病例。
“本土出現新冠病毒感染病例,這是大事,必須馬上進(jìn)行病毒基因溯源?!焙窝徘嗄X中的警鈴立馬拉響,她第一時(shí)間打電話(huà)給團隊相關(guān)成員,做好要回單位做新冠病毒全基因組序列測定的準備。何雅青立即給中心領(lǐng)導發(fā)了信息——“已安排:如出現陽(yáng)性病例,第一時(shí)間測序”。
晚上11點(diǎn)半,經(jīng)過(guò)實(shí)驗確認,證實(shí)是新冠病毒核酸陽(yáng)性。之后,第二個(gè)核酸檢測可疑陽(yáng)性的樣本也送到市疾控中心,經(jīng)實(shí)驗室確認,證實(shí)出現第二例新冠病毒感染者。
基因測序需要經(jīng)過(guò)樣本前處理、文庫構建、測序反應、生物信息學(xué)分析等步驟,其中,文庫構建包括RNA反轉錄、擴增等。團隊里的朱燦身兼核酸檢測和病毒溯源組的工作,7號凌晨4點(diǎn),核酸檢測工作結束后,朱燦又連忙開(kāi)始了做基因測序的文庫構建的第一步,進(jìn)行RNA反轉錄?!盎驕y序流程一環(huán)扣一環(huán),特別是出現了本土病例,每個(gè)人都打起了100分精神,不敢絲毫松懈?!焙窝徘嗾f(shuō),在這緊張忙碌的過(guò)程中,發(fā)生了很多讓她感動(dòng)的事。
為了盡快出結果,按何雅青幾小時(shí)前的安排,1月7號凌晨5點(diǎn),天還沒(méi)亮,測序組的魏欣儀就已經(jīng)急忙從家里趕回單位,著(zhù)手測序工作。組里另一成員陳龍原定7號白天出發(fā)去甘肅提親,得知出現本土病例需要病毒溯源后,考慮到疫情影響怕不能及時(shí)返深,7號早上五六點(diǎn)便打電話(huà)給何雅青,表示推遲提親,先回所里開(kāi)展工作。
基因溯源,讓病毒來(lái)源“一錘定音”
7號早上八點(diǎn)多,官方公布深圳報告2例新冠確診病例的消息后,坊間開(kāi)始有謠言出現,有人說(shuō)是奧密克戎,有人說(shuō)是德?tīng)査?。為了盡快出結果,堵住謠言,團隊更是不敢松懈?!皽y序反應步驟結束下機時(shí),拿著(zhù)原始數據,組員李詩(shī)敏和盧清菊從二樓跑到四樓,第一時(shí)間把U盤(pán)插到服務(wù)器上,迅速開(kāi)始拼接病毒基因序列,一秒鐘都不敢耽誤?!焙窝徘嗾f(shuō),“還有,學(xué)生屈雅麗在本次溯源中,也十分投入,成長(cháng)很快?!?/p>
1月7日晚上8時(shí),基因測序結果出爐,顯示此次病例1和病例2感染的新冠病毒為德?tīng)査儺愔辏ˋY.103進(jìn)化分支),兩者的同源性為100%?!笆堑?tīng)査儺愔?,不是奧密克戎!”報告的出爐為病毒型別“一錘定音”,何雅青也大松一口氣,立馬把這消息向上級領(lǐng)導報告。
晚上11點(diǎn)12分,深圳衛健委微信公眾號發(fā)文“深圳2例確診病例基因測序結果:為德?tīng)査儺愔辍?。推文一出,大家紛紛轉發(fā)。對所有人來(lái)說(shuō),這都是一個(gè)好消息。
何雅青告訴記者,奧密克戎相對德?tīng)査?,傳播性更強,如果是奧密克戎,深圳恐怕會(huì )面臨更大的挑戰,相關(guān)工作人員的排查工作也會(huì )更艱巨?!案匾氖?,我們此前還沒(méi)有處理奧密克戎的經(jīng)驗,這意味著(zhù)風(fēng)險性也更大?!?/p>
技術(shù)護航,科學(xué)研判疫情
何雅青介紹,此次新冠病毒全基因組序列測定使用的是高通量測序技術(shù),也稱(chēng)二代測序技術(shù)?!?021年5月11日國家發(fā)布的第八版新冠肺炎防控方案中有明確指出新冠病毒溯源要使用二代測序技術(shù),我們單位一直采用這個(gè)技術(shù)進(jìn)行新冠病毒的溯源實(shí)驗,包括去年的‘5.21’和‘6.14’疫情?!?/p>
在何雅青看來(lái),出現新冠病毒本土病例后,第一時(shí)間進(jìn)行病毒溯源十分重要?!拔覀兪紫纫_定病毒的型別,然后要確定病毒的來(lái)源。對不同型別的新冠病毒,我們劃定的重點(diǎn)人群和重點(diǎn)區域,以及所采取的防控措施是有所不同的。其次,通過(guò)與深圳、廣東省、全國輸入病例以及國外的新冠病毒序列的比較,可以確定病毒的源頭”,何雅青表示,通過(guò)病毒基因序列的比對,可以推斷疫情的傳播的源頭是否是同一來(lái)源——如果病例的新冠病毒全基因序列高度同源,可以推斷是同一感染來(lái)源或同一傳播鏈。如果新冠病毒全基因序列不是同一個(gè)型別,或者同源性不高,就可以推斷是不同來(lái)源的新冠病毒,這對疫情的研判起到至關(guān)重要的作用。
年輕“勁”足,與病毒源頭抗戰到底
高效溯源工作背后,是一支年輕的團隊。
第一個(gè)“年輕”是成立時(shí)間短。2020年1月,何雅青工傷初愈回到所里上班后,第一件事就是組建新冠溯源平臺?!白鳛橐粋€(gè)病毒分子流行病學(xué)的研究學(xué)者,我始終覺(jué)得我們該有自己的病毒基因溯源團隊?!焙窝徘嗾f(shuō)干就干,擬項目、組團隊、買(mǎi)設備,深圳市疾控中心新冠溯源團隊不到一個(gè)月就已成形。
第二個(gè)“年輕”是平均年齡小。何雅青組建的這支團隊,平均年齡也很年輕,大部分為90后,甚至還有00后?!安《舅菰床⒉皇且粋€(gè)輕松的工作,我們常常要跟病毒賽跑?!痹诤窝徘嗫磥?lái),年輕人有活力,有干勁,學(xué)習快,肯吃苦,正好與基因溯源工作相契合。
自組建以來(lái),不分白日晝夜,不分節假日,熬夜加班成了這支團隊的家常便飯。平時(shí),他們需要承擔新冠病毒日常檢測和確認、信息報送工作,遇到新冠病毒陽(yáng)性樣本報告時(shí),便要爭分奪秒地開(kāi)始新冠病毒溯源工作?!懊客瓿梢淮嗡菰垂ぷ?,判斷出病毒的源頭,我們都會(huì )深感自豪?!焙窝徘嗾f(shuō)。
從“5.21”到“6.14”,再到此次的“0107”疫情,這已經(jīng)是團隊第三次遇到突發(fā)新冠病毒本土病例的“考試”。每一次,何雅青的團隊交出的“考卷”分數都刷新高,基因測序時(shí)長(cháng)從一開(kāi)始的27小時(shí)到24小時(shí),再到這次的16小時(shí),為政府決策以及流調人員排查潛在感染者(密切接觸者)多爭取了寶貴的8小時(shí),保護了更多人的生命健康。